MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_03

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021869	TGT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222928
2	NC_021869	G	7	7	408	414	0 %	0 %	100 %	0 %	526222928
3	NC_021869	ACAG	2	8	436	443	50 %	0 %	25 %	25 %	526222928
4	NC_021869	ACG	2	6	569	574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222928
5	NC_021869	TGA	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
6	NC_021869	T	6	6	687	692	0 %	100 %	0 %	0 %	526222928
7	NC_021869	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222928
8	NC_021869	TGGAA	2	10	719	728	40 %	20 %	40 %	0 %	526222928
9	NC_021869	GCAAC	2	10	845	854	40 %	0 %	20 %	40 %	526222928
10	NC_021869	TGA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
11	NC_021869	TCGCTG	2	12	1013	1024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
12	NC_021869	TCCAGC	2	12	1032	1043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526222929
13	NC_021869	TGC	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
14	NC_021869	GCC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
15	NC_021869	GCT	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
16	NC_021869	CCTG	2	8	1140	1147	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
17	NC_021869	CGCT	2	8	1163	1170	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
18	NC_021869	AGT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
19	NC_021869	CTG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
20	NC_021869	GCT	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
21	NC_021869	ATC	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
22	NC_021869	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
23	NC_021869	CGC	2	6	1422	1427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
24	NC_021869	GAT	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
25	NC_021869	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
26	NC_021869	CCA	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
27	NC_021869	CAG	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
28	NC_021869	GGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
29	NC_021869	TTCTC	2	10	1659	1668	0 %	60 %	0 %	40 %	526222929
30	NC_021869	CTG	3	9	1741	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
31	NC_021869	C	6	6	1829	1834	0 %	0 %	0 %	100 %	526222929
32	NC_021869	ATGCTG	2	12	1848	1859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526222929
33	NC_021869	CAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
34	NC_021869	C	6	6	1931	1936	0 %	0 %	0 %	100 %	526222929
35	NC_021869	CCG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
36	NC_021869	GCCT	2	8	2134	2141	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
37	NC_021869	CAG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
38	NC_021869	GCC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
39	NC_021869	AGGAC	2	10	2311	2320	40 %	0 %	40 %	20 %	526222929
40	NC_021869	T	6	6	2334	2339	0 %	100 %	0 %	0 %	526222929
41	NC_021869	CTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222929
42	NC_021869	CAG	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
43	NC_021869	ACCGG	2	10	2439	2448	20 %	0 %	40 %	40 %	526222929
44	NC_021869	CCG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
45	NC_021869	ATC	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
46	NC_021869	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
47	NC_021869	GCC	2	6	2586	2591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222931
48	NC_021869	AGC	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
49	NC_021869	GCGG	2	8	2688	2695	0 %	0 %	75 %	25 %	526222931
50	NC_021869	CAG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
51	NC_021869	CGG	2	6	2764	2769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
52	NC_021869	AT	3	6	4293	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	526222932
53	NC_021869	ACG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
54	NC_021869	AAT	2	6	4314	4319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222932
55	NC_021869	CAT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222932
56	NC_021869	AAG	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222932
57	NC_021869	CAG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
58	NC_021869	AATT	2	8	4484	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	526222932

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.